DNAm age (DNA methylation age, эпигенетический возраст) — это оценка биологического возраста по уровню метилирования ДНК. Термин чаще всего относится к первым эпигенетическим часам Стива Хорвата (2013).
Часы Хорвата используют 353 CpG-сайта и работают в разных тканях, предсказывая паспортный возраст с медианной ошибкой около 3,6 года (корреляция r≈0,96).
Часы Хорвата и Ханнума
Термин DNAm age чаще всего относят к часам Стива Хорвата (2013): они используют 353 CpG-сайта, обучены на 8000 образцах из 51 типа тканей и работают в разных тканях без поправок. Одновременно вышли часы Ханнума (71 сайт, кровь). Обе модели относятся к первому поколению — их обучали предсказывать паспортный возраст.
DNAm age и ускорение возраста
Разница между DNAm age и хронологическим возрастом называется эпигенетическим ускорением возраста. Положительное значение связано с повышенной смертностью. На фундаменте этих часов позже построили второе поколение — PhenoAge и GrimAge.
Ограничения
Так как первые часы обучали на паспортном возрасте, а не на здоровье, они слабее предсказывают болезни и смерть, чем часы второго поколения. Результат зависит от ткани и лаборатории. Это исследовательский, а не диагностический инструмент.
Рассчитать по этому показателю
Калькуляторы, где DNAm Age используется напрямую:
Частые вопросы
Чем DNAm age отличается от PhenoAge и GrimAge?
DNAm age (часы первого поколения) обучены предсказывать календарный возраст. PhenoAge и GrimAge обучены на показателях здоровья и смертности, поэтому лучше предсказывают болезни и риск смерти.
Насколько точны часы Хорвата?
Они предсказывают паспортный возраст с медианной ошибкой около 3,6 года и корреляцией r≈0,96. Но точное совпадение с календарём — не то же самое, что предсказание здоровья.
Связанные термины
Источники
- Wikipedia — Epigenetic clock (Horvath clock)
- Levine et al. An epigenetic biomarker of aging (Aging, 2018)